根据学院定位，在遵循学科专业发展规律和人才培养规律的基础上，学院通过整合不同校区、不同专业的教学内容，全面调整学科专业结构，初步建立起多学科兼容、各学科协调发展的学科设置体系；初步建立起适应市场需要和具有学院自身特点的学科专业调节机制。

    根据凉山州“立足资源，拓展两线，开发三江，发展三带经济，统筹区域协调发展”的“十一五”规划，为抓住西部大开发的历史机遇，学院大力发展适应区域经济建设和社会事业发展要求的应用型专业，以适应区域内丰富的生物、水能、矿产、旅游资源的开发，为地方经济建设和社会事业发展服务。至2006年，学院本科专业增至35个，专业设置涵盖了理学、工学、文学、法学、管理学、教育学等7个学科门类。

    2003年以来，学院共承担自然科学研究项目113项，其中108项与凉山社会经济发展紧密相关，与凉山州的经济发展吻合度达95.57%；承担哲学社会科学研究115项，其中98项与凉山社会经济发展紧密相关，与凉山州的社会发展吻合度达85.22%。历年来，西昌学院获得78项自然科学科技成果，专利4项，获150项哲学社会科学成果。通过州级以上鉴定项目27项，选育的苦荞新品种“西荞一号”，蚕豆新品种“凉胡5号”、“凉胡6号”，洋葱新品种“西葱一号”、“西葱二号”的示范推广等15项推广成果获社会经济效益5.52亿元。

    截至2007年，西昌学院共培养各类人才（含成人教育毕业生）76659人。凉山州和在州省属企事业单位共有各类人才11.2万人，西昌学院的学生（毕业生和在学院受过3个月以上培训的学生）有46300余人，占在州工作的各级各类人才总数的41.35%；成人教育共培养毕业生39286人，其中为凉山州培养成人教育毕业生30257人，占成人教育毕业生总数的77.02%。全州中小学教师共有教职工40769人，毕业于学院的13421人，占32.92%；全州畜牧系统职工1651人，西昌学院毕业、培训的达1102人，占66.75%，凉山州畜科所职工69人，42人毕业或曾在学院培训，占60.87%；凉山州最大的民营企业──西昌华宁农牧科技有限公司，共有职工242人，其中235人曾在西昌学院学习、进修，占职工总数的97.1%；全州农业系统共有职工3991人，其中1641人毕业、培训于西昌学院占41.10%，凉山州农科所职工95人，64人毕业或参加学院培训，占67.37%；凉山州烟草公司2452职工中，1252人由学院毕业或培训，占51.10%；凉山州建筑行业助工以上技术人员2310人，1893人由学院培养，占81.90%。

    西昌学院在办学定位、办学特色、专业设置、科学研究等方面都紧密围绕地方社会经济发展状况与资源优势，为凉山州资源开发、经济、社会发展培养了一大批懂管理、懂技术、留得住、用得上的人才；为地方经济建设和社会发展做出了重要贡献。